Az eredetileg Új Galícia Királyságának nevezett város története folytatódik.
Itt található a régi Santo Tomás de Aquino jezsuita főiskola is, amelyet a 16. század utolsó évtizedében építettek, és amelyet 1792-ben az egyetem foglalt el. Az építkezésből csak az maradt meg, amely a múlt század monumentális kupolájával ellátott templom és a hozzá csatolt Loreto-kápolna volt, amelyet Juan María de Salvatierra 1695-ben épített. A 16. században Don Pedro Gómez Maraver építtette San Juan de Dios templomát, amely korábban a Santa Veracruzi kápolna volt, józan jellegű barokk homlokzattal építették. A San Juan de Dios-hoz hasonló barokk stílusú La Merced templomot, bár díszesebb, a 17. században Miguel Telmo és Miguel de Albuquerque atyafiak alapították.
A La Soledad templomot a 17. század vége és a 18. század elején építették Juana Romana de Torres és férje, Juan Bautista Panduro kapitány kérésére. Ezen a helyen állt a Magányos Miasszonyunk és a Szent Sír testvérisége, amely egy San Francisco Xavier-nek szentelt kápolnát foglalt el. San Diego temploma és iskolája, a XVII. Század műve; az első nagyon józan ajtóval, amely már látszólag a neoklasszikus stílushoz tartozik, a második pedig egy gyönyörű árkáddal, amely régi kolostorát díszíti.
Az azonos nevű kolostorhoz csatolt Jesús María templomot 1722-ben alapították; továbbra is őrzi barokk homlokzatait, amelyeken a Szent Családot, a Virgen de la Luz-ot, San Franciscót és Santo Domingót ábrázoló nagy szobrokat láthat.
Végül fontos kiemelni még három vallási konstrukciót, amelyek a legjobb példákként jelentek meg, mindegyikük a maga nemében, a gyarmati építészet fejlődésének Guadalajarában, főként a XVII – XVIII. Így rendelkezésünkre áll a 18. század közepétől származó Aránzazu-kápolna, kíváncsi haranglábjával és belső terével, amelyet csodálatos festmények és Churrigueresque-oltárképek díszítenek ugyanabból az időszakból és a város legjobbjának tekintik. A Santa Mónica kolostor és templom, amelyet Feliciano Pimentel atya alapított a 18. század első felében; temploma dupla homlokzatot mutat be gazdag díszítéssel, amely a dús salamon barokk stílus legjobb példájaként szerepel. San Felipe Neri temploma, amelyet 1766-ban Pedro Ciprés építész építtetett, rendkívüli józanságot alkot, amely díszei platereszk emlékezetű elemeket foglalnak magukba, amely szempontból a templom Guadalajara legjobb vallási épülete.
A polgári építészetnek megfelelő építményekben van néhány csodálatra méltó épület, amelyek között megemlíthetjük a Kormánypalotát, régi királyi házakat, amelyeket a 18. században Juan Francisco Espino hadmérnök projektje nyomán módosítottak, bár a homlokzat Miguel José Conique műve. Az épület lényegében a barokk stílusban készült, de bizonyos neoklasszikus tendenciák már észrevehetők benne. A királyi hivatalok, amelyek az eltűnt Palacio de Medrano épületében voltak, és a tárgyalótermek a helyszínen működtek.
Megvan nálunk az a San José-nak szentelt Conciliar Szeminárium is, amelyet Galindo y Chávez püspök avatott fel 1701-ben, és amelyet ma a guadalajarai Regionális Múzeum foglal el, a toszkán stílusú oszlopok fő kolostorával és barokk ajtóival. A híres Hospicio Cabañas a 19. század elején épült, a jeles építész, Manuel Tolsá tervei nyomán, José Gutiérrez rendezésében és évekkel később Gómez Ibarra építész által elkészített művet rendezve, amely a neoklasszikus stílus figyelemre méltó példája.
A Guadalajara városának stiláris egységet biztosító egyéb kisebb építkezések közül megemlíthetjük, bár nem mindegyiket őrizzük meg: a hatalmas, 16. századi kastélyt, amely az egykor az Analco negyedben található San Sebastián tér előtt állt. A Calle de la Alhóndiga 114. számú ház, jelenleg Pino Suárez. A Sánchez Leñero családhoz tartozó rezidenciák a 37., Dionisio Rodríguez úréi pedig a Calle de Alcalde 133. szám alatt. A Calderón-ház, egy hagyományos gyarmati cukorkabolt, amelyet 1729-ben alapítottak, és Santa Teresa és Santuario, manapság Morelos és Pedro Loza régi utcáinak sarkán található; neoklasszikus stílusú Francisco Velardeé, végül a Cañedo-kúria volt, a székesegyház hátsó része előtt.
Az ország harmadik legfontosabb városa, Guadalajara közelében található San Juan Bautista Melzquititlán óvárosa, ma San Juan de los Lagos. Ez a város fontos vallási központtá vált a bazilikát őrző Szűz Mária-kép nagyszerű csodálatos hagyományának köszönhetően, amelyet a 17. század közepén épített Don Juan Rodríguez Estrada. Ugyanabban a városban más építkezéseket is láthat, mint például a Harmadik Rend temploma, a Kálvária-kápolna, az Első Csoda kápolna, amelyek a 17. és a 18. századból származnak. Fontos civil épületek is vannak a lakosságban, mint például a Főiskola Palotája és a Tizedek épülete.
Lagos de Moreno városában megtekintheti a fő plébániát, a 17. századi művet, gyönyörű homlokzattal, Churrigueresque stílusban.
Végül a San Pedro Tlaquepaque-ban található néhány példa a régió barokk vallási építészetére, mint például a San Pedro plébánia és a soledadi templom.
