Calleja a központi hadsereg (1810–12) szervezője és főnöke volt a szabadságharc idején, valamint Új-Spanyolország hatvanadik alispánja, aki 1813–1816 között uralkodott, és Mexikó történelmének egyik nagy gazembere volt.
A valladolidi Medina del Campóban született és Valenciában halt meg. Első hadjáratát másodhadnagyként hajtotta végre a rossz sorsú algériai expedícióban, amelyet O'Reilly gróf vezetett III. Károly uralkodása alatt. Tanára és kapitánya volt egy 100 kadétból álló társaságnak, akik között volt Joaquín Blacke, Spanyolország után régens, és Francisco Javier de Elío, Buenos Aires leendő alispánja, a Puerto de Santa María Katonai Iskola.
Revillagigedo második grófjával (1789) érkezett Új-Spanyolországba, a Puebla állandó gyalogezredhez csatlakozott kapitányként, és számos megbízást sikeresen végrehajtott, amíg a San Luis Potosí dandár parancsnokává nevezték ki. Parancsnoksága alatt ott állt a csapatok kantonja, amelyet Marquina alkirály gyűjtött össze, akit társaságával együtt Ignacio Allende kapitány vett részt. Ott vette feleségül Doña Francisca de la Gándarát, annak a városnak a királyi zászlós lányát is, aki a nagy Hacienda de Bledos tulajdonosa volt; és nagy befolyást szerzett az ország népére, akik őt "Don Félix mesterként" ismerték.
Amikor Hidalgo felkelése bekövetkezett, anélkül, hogy megvárta volna az alkirály parancsát, fegyverbe adta brigádjának csapatait, újakkal gyarapította őket, megszervezte és fegyelmezte őket, megalakította a központ kicsi (4000 ember), de hatalmas seregét, amelynek sikerült legyőznie. Hidalgo és szembe kell néznie a Morelos által megkezdett félelmetes offenzívával.
Calleja Cuautla ostroma után (1812. május) visszavonult Mexikóba, lakóhelyén (Casa de Moncada, később Palacio Iturbide néven szerepelt) volt egy kis bírósága, ahol egyetértett a venegasi kormány iránti elégedetlenség, akit pénzhiánnyal vádoltak és tehetetlen a forradalom megfékezésére és befejezésére. Körülbelül 4 évvel később alkirályként irányította az országot. A hadsereget úgy fejezte be, hogy elérte a 40 000 soros és tartományi milícia emberét, valamint annyi királyi ember szerveződött az összes városban és birtokon, hogy mindketten többnyire elhagyják a forradalomban lévő tartományokat; átszervezte az államkincstárt, amelynek termékei új adókkal növekedtek; visszaállította a merkantil forgalmat a gyakori konvojokkal, amelyek ismét a királyság egyik végéből a másikba keringtek, és a rendszeres postai szolgálatot; és növelte a teljesítményt és a vámtermékeket.
Ez azt feltételezi, hogy a felkelők ellen folytatott folyamatos és intenzív kampányokat Morelos megadta. Határozott és gátlástalan ember, nem állította meg magát a médiában, és lehunyta a szemét a parancsnokai által elkövetett visszaélések előtt, ha azok buzgón szolgálták az igazi ügyet. Így gyűlölködővé vált kortársaival szemben.
Visszatért Spanyolországba, megkapta Calderón gróf címét (1818), valamint Isabel la Católica és San Hermenegildo nagy keresztjeit. Miután andalúziai főkapitány és cádizi kormányzó volt, ő vezényelte a dél-amerikai expedíciós csapatokat, amelyek távozása előtt felálltak és börtönbe csökkentették (1820). Szabadon engedve megtagadta a valenciai kormányt, és 1823-ig ismét Mallorcán zárták. 1825-ben "megtisztítva" haláláig a valenciai laktanyában maradt.
