A dombok lejtőin épült város városszerkezetének alkalmazkodnia kellett a terep topográfiai szempontjaihoz, bár megpróbált tiszteletben tartani egy retikuláris formát, mint egy sakktábla.
Ez a szempont végül lehetővé tette, hogy kimért és harmonikus módon növekedjen, ami az évszázadok során megőrizte eredeti jellegét. Alapja annak az igénynek a megteremtése, hogy meg kell védeni és meg kell védeni azokat az utazókat, akik Zacatecas és az akkori Új Spanyolország királyságának fővárosa között közlekedtek, főként ásványi anyagokat szállítottak, és akiket a chichimecai nemzet őshonos nomádjai ostromoltak. San Miguel a jelenlegi város közelében Itzcuinapan nevű várost alapított, San Miguel arkangyalot védőszentnek szentelve. Ennek a primitív lakosságnak súlyos problémái voltak a vízellátással, a környező régiók őshonos Csicsimecáinak folyamatos és erőszakos támadásai mellett. Emiatt a Villa de San Miguel lakói néhány kilométerrel északkeletre költöztették a települést; Ez volt az a hely, ahol 1555-ben Don Luis de Velasco alkirály kérésére Don Ángel de Villafañe megalapítja a Villa de San Miguel el Grande-t. Az alkirály azt is követelte, hogy ott települjenek le spanyol szomszédok, akiknek földet és állatállományt adnak, míg az abban élő őslakosoknak megbocsátják a tiszteletdíjat, és a jövőbeni lázadások elkerülése érdekében saját főnökeik irányítják őket.
1826. március 8-án az Állami Kongresszus várossá tette és nevét megváltoztatta, amely ezentúl San Miguel de Allende lesz, az 1779-ben ott született híres felkelő tiszteletére.
Ezen a vonzó gyarmati képen belül annak idején több valóban figyelemre méltó palota is helyet kapott. A legkiemelkedőbbek közé tartozik a Városi Palota, korábban az 1736-ban épült városháza. Az a ház, ahol Ignacio Allende született, a város barokk építészetének példája, különösen annak homlokzatán, és amely jelenleg a Regionális Múzeum. A gyönyörű neoklasszikus homlokzattal rendelkező Casa del Mayorazgo de la Canal-t a 18. század vége felé José Mariano de la Canal y Hervas éger, dékán és királyi zászlós készítette el. A Don Manuel T. de la Canal régi kastélya, egy 1735-ben készült építkezés, amelyet Don Manuel Tolsá jeles spanyol építész projektje szerint felújítottak 1809-ben; Az épület jelenleg az Allende Intézetnek ad otthont, és kiemeli belső udvarainak szélességét, egy gyönyörű kápolnát és rendkívüli boltíveit. Az inkvizítor háza, amely a Szent Iroda biztosának rezidenciájaként szolgált, és 1780-ból származik. A 18. század végén épült Marqués de Jaral de Berrio ház, valamint a Loja grófok elegáns homlokzatával.
Ami a vallási építészetet illeti, a város rendkívüli értékű építészeti kincsekkel is büszkélkedhet, mint például a Santo Domingo templom és kolostor, egy józan épület 1737-től. A Leal de la Concepción kolostor, amely jelenleg Kulturális Központ, Figyelemre méltó épület hatalmas terasza miatt; A 18. században Francisco Martínez Gudlño építész építtette.
A Santa Cruz del Chorro kápolna, az egyik legrégebbi; a Harmadik Rend temploma, amely a tizenhetedik század elejéről származik. A San Felipe Neri templom és oratórium gyönyörű komplexuma a 18. század elejéről; a templom virágzó barokk homlokzattal rendelkezik, amelyet rózsaszínű kőfejtőben készítenek, és amelyet erős bennszülött hatás díszít. Belseje változatos és gazdag dekorációval rendelkezik a bútorok, a szobrok és a csodálatra méltó festmények között, a Santa Casa de Loreto és a Camarín de la Virgen csodálatos kápolnája mellett, mind gyönyörűen díszítve, mind Manuel márki odaadásának köszönhetően. Tomás de la Canal. A szónoklat közelében található a Miasszonyunk temploma, amelyet a 18. században építettek be süllyesztett homlokzatával, amelyet egy nagy héj koronáz meg.
Szintén a város legvonzóbbjai közé tartozik a 18. századi San Francisco-templom, gyönyörű Churrigueresque homlokzatával, a híres plébánia pedig szinte San Miguel de Allende szimbóluma; Bár neogótikus stílusú építése újabb keletű, a régi 17. századi templom szerkezetére épült, teljes mértékben tiszteletben tartva annak belső terét és eredeti tervét.
A városhoz nagyon közel van az Atotonilco szentély, egy józan méretű, 13. századi építkezés, amely erődítménynek tűnik, és amelyen belül ugyanazon évszázad értékes festményeit őrzik.
